Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxcl2P10889 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl2P10889 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms