Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Tnp1P10856 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms