Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl2P10148 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms