Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Schip1P0DPB4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms