Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LtaP09225 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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