Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc8P09025 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc8P09025 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms