Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb7P09024 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms