Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NefmP08553 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NefmP08553 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NefmP08553 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NefmP08553 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NefmP08553 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NefmP08553 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NefmP08553 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms