Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spta1P08032 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spta1P08032 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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