Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TnfP06804 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TnfP06804 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TnfP06804 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnfP06804 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnfP06804 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnfP06804 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TnfP06804 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms