Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06344 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06344 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06344 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06344 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06344 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06344 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06344 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06344 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06344 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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