Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-T23P06339 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-T23P06339 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms