Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06324 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06324 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06324 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06324 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06324 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms