Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P06323 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P06323 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P06323 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P06323 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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