Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prp2P05143 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prp2P05143 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms