Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01800 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01800 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01800 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01800 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01800 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01800 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01800 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01800 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms