Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01673 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01673 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01673 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01673 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01673 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01673 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01673 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01673 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms