Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01641 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01641 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01641 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms