Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01638 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01638 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01638 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01638 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01638 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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