Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01636 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01636 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01636 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01636 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms