Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifnb1P01575 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifnb1P01575 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms