Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sypl2O89104 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sypl2O89104 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sypl2O89104 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sypl2O89104 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sypl2O89104 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms