Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms