Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gnpda1O88958 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms