Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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F11rO88792 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
F11rO88792 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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F11rO88792 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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F11rO88792 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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F11rO88792 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F11rO88792 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
F11rO88792 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
F11rO88792 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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