Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tom1O88746 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tom1O88746 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms