Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClppO88696 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClppO88696 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClppO88696 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClppO88696 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClppO88696 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClppO88696 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClppO88696 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClppO88696 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms