Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dll3O88516 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dll3O88516 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dll3O88516 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms