Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CntfrO88507 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CntfrO88507 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CntfrO88507 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntfrO88507 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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