Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cfdp1O88271 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cfdp1O88271 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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