Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtssO70370 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtssO70370 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtssO70370 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms