Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb5O70309 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms