Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd70O55237 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd70O55237 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms