Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ldb2O55203 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms