Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms