Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx4O55187 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms