Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms