Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnk2O54967 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms