Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LatO54957 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LatO54957 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LatO54957 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LatO54957 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LatO54957 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LatO54957 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LatO54957 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms