Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6bO54951 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms