Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itgb3O54890 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms