Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CrxO54751 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CrxO54751 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CrxO54751 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms