Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EdaO54693 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EdaO54693 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EdaO54693 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EdaO54693 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EdaO54693 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EdaO54693 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EdaO54693 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms