Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gp1baO35930 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms