Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms