Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timm44O35857 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms