Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms