Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms