Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a2O35488 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a2O35488 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms