Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf5O35445 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf5O35445 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms